床暖房用のコントローラーは一般的に床温を設定する温度調節器の機能と使いたいときに通電する24時間タイマー機能が付いている。温度の検出は床暖房内や室温、またはそれらを同時に検出してコントロールしている場合もある。（立ち上がりの早い床暖房はそれだけ蓄熱量が小さいため、温度変化に敏感に反応することになり、動作回数も多くなり、寿命も短くなる傾向にある。アクアレイヤーは蓄熱量が非常に大きいので、一度温まってしまうとなかなか冷めずコントローラーの動作回数も極端に少なくなり、非常に有利である。）